Если до момента завершения реорганизации уточненный расчет по форме 6-НДФЛ не был представлен реорганизованной организацией, то такой расчет подлежит представлению правопреемником. Следовательно, в отношении работников ликвидированного обособленного подразделения уточненный расчет 6-НДФЛ следует подавать уже по месту учета головной организации (письмо ФНС России от 13 марта 2019 г. № БС-4-11/4405@).
В случае осуществления налоговым агентом перерасчета сумм НДФЛ за период, который относится к деятельности ликвидированного обособленного подразделения, следует представить в налоговый орган по месту учета налогового агента уточненный расчет по форме 6-НДФЛ за соответствующий отчетный период с указанием ИНН и КПП налогового агента, а ОКТМО – ликвидированного обособленного подразделения.
По строке 090 расчета указывается общая сумма налога, подлежащая возврату налоговым агентом, нарастающим итогом с начала налогового периода.